Program Studi pada Kopertais Wil. 03 (DI Yogyakarta)

No. Program Studi Nama PTKIS Detail
1. 
Pendidikan Agama Islam
STIT Muhammadiyah Wates, Kulonprogo
2. 
Pendidikan Agama Islam
STAI Yogyakarta (STAIYO) Wonosari, Gunung Kidul
3. 
Hukum Keluarga (Ahwal Syakhshiyah)
STAI Yogyakarta (STAIYO) Wonosari, Gunung Kidul
4. 
Pendidikan Bahasa Arab
STAI Yogyakarta (STAIYO) Wonosari, Gunung Kidul
5. 
Pendidikan Guru MI (PGMI)
STAI Yogyakarta (STAIYO) Wonosari, Gunung Kidul
6. 
Manajemen Dakwah
STAI Terpadu Yogyakarta
7. 
Manajemen Pendidikan Islam
STAI Terpadu Yogyakarta
8. 
Ilmu Al-Qur`an dan Tafsir
STAI Sunan Pandanaran Yogyakarta
9. 
Akhlak dan Tasawuf
STAI Sunan Pandanaran Yogyakarta
10. 
Komunikasi dan Penyiaran Islam
STAI Masjid Syuhada (STAIMS) Yogyakarta
11. 
Pendidikan Agama Islam
STAI Masjid Syuhada (STAIMS) Yogyakarta
12. 
Pendidikan Bahasa Arab
STAI Masjid Syuhada (STAIMS) Yogyakarta
13. 
Pendidikan Agama Islam
STAI Alma Ata Yogyakarta
14. 
Ekonomi Syari`ah
STAI Alma Ata Yogyakarta
15. 
Perbankan Syari`ah
STAI Alma Ata Yogyakarta
16. 
PGMI
STAI Alma Ata Yogyakarta
17. 
Komunikasi dan Penyiaran Islam
STAI Al-Muhsin Krapyak Yogyakarta
18. 
Perbankan Syari`ah
STAI Al-Muhsin Krapyak Yogyakarta
19. 
Pendidikan Islam Anak Usia Dini (PIAUD)
Sekolah Tinggi Pendidikan Islam (STPI) Bina Insan Mulia Yogyakarta
20. 
Pendidikan Agama Islam
Sekolah Tinggi Ilmu Al-Qur`an (STIQ) An-Nur Yogyakarta
21. 
Tafsir Hadits
Sekolah Tinggi Ilmu Al-Qur`an (STIQ) An-Nur Yogyakarta
22. 
Keuangan dan Perbankan Syari`ah
Sekolah Tinggi Ekonomi Islam (STEI) Hamfara Yogyakarta
23. 
Manajemen Syari`ah
Sekolah Tinggi Ekonomi Islam (STEI) Hamfara Yogyakarta
24. 
Ekonomi Syari`ah
Sekolah Tinggi Ekonomi Islam (STEI Yogyakarta)
25. 
Manajemen Syari`ah
Sekolah Tinggi Ekonomi Islam (STEI Yogyakarta)
26. 
Perbankan Syari`ah
Fakultas Syari`ah dan Ekonomi Islam Univ. Iskandar Muda Banda Aceh
27. 
Komunikasi dan Penyiaran Islam
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
28. 
Hukum Ekonomi Syari`ah (Mu`amalah)
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
29. 
Ilmu Agama Islam
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
30. 
Pendidikan Agama Islam
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
31. 
Politik Islam
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
32. 
Psikologi Pendidikan Islam
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
33. 
Pendidikan Bahasa Arab
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
34. 
Pengkajian Islam
FAI Univ. Islam Indonesia (UII) Yogyakarta
35. 
Ekonomi Syari`ah
FAI Univ. Islam Indonesia (UII) Yogyakarta
36. 
Hukum Islam
FAI Univ. Islam Indonesia (UII) Yogyakarta
37. 
Hukum Keluarga (Ahwal Syakhshiyah)
FAI Univ. Islam Indonesia (UII) Yogyakarta
38. 
Pendidikan Agama Islam
FAI Univ. Islam Indonesia (UII) Yogyakarta
39. 
Hukum Keluarga (Ahwal Syakhshiyah)
FAI Univ. Cokroaminoto Yogyakarta (UCY)
40. 
Pendidikan Agama Islam
FAI Univ. Cokroaminoto Yogyakarta (UCY)
41. 
Bahasa dan Sastra Arab
FAI Univ. Ahmad Dahlan (UAD), Yogyakarta
42. 
Pendidikan Agama Islam
FAI Univ. Ahmad Dahlan (UAD), Yogyakarta
43. 
Tafsir Hadits
FAI Univ. Ahmad Dahlan (UAD), Yogyakarta