Fakultas Syari`ah pada Kopertais Wil. 03 (DI Yogyakarta)

No. Nama PTKIS Fakultas/
Jurusan
1. 
FAI Univ. Cokroaminoto Yogyakarta (UCY)
Syari`ah
2. 
FAI Univ. Islam Indonesia (UII) Yogyakarta
Syari`ah
3. 
FAI Univ. Muhammadiyah Yogyakarta
Syari`ah
4. 
Sekolah Tinggi Ekonomi Islam (STEI Yogyakarta)
Syari`ah
5. 
Sekolah Tinggi Ekonomi Islam (STEI) Hamfara Yogyakarta
Syari`ah
6. 
STAI Alma Ata Yogyakarta
Syari`ah
7. 
STAI Al-Muhsin Krapyak Yogyakarta
Syari`ah
8. 
STAI Yogyakarta (STAIYO) Wonosari, Gunung Kidul
Syari`ah